| Registro completo |
| Provedor de dados: |
Infoteca-e
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| País: |
Brazil
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| Título: |
Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.
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| Autores: |
HIGA, R. H.
GIACHETTO, P. F.
YAMAGISHI, M. E. B.
IBELLI, A. M. G.
REGITANO, L. C. de A.
CARDOSO, F. F.
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| Data: |
2011-03-29
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| Ano: |
2010
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| Palavras-chave: |
Agrupamento de dados
Expressão gênica
Rede Genômica Animal
Análise de componentes principais - PCA.
Análise Estatística.
Gene expression
Algorithms
Statistical analysis
Principal component analysis
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| Resumo: |
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
bitstream/item/32433/1/ct101-10-4.pdf
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| Tipo: |
Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
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| Idioma: |
Português
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| Identificador: |
15640
http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/883623
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| Editor: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010.
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| Relação: |
Embrapa Informática Agropecuária - Comunicado Técnico (INFOTECA-E)
(Embrapa Informática Agropecuária. Comunicado técnico, 101).
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| Formato: |
11 p.
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